Kā zinātnieki izmanto mikroarray analīzi?

Mikromasīvu analīze ietver šūnas atvēršanu, tās ģenētiskā satura izolēšanu, visu konkrētajā šūnā ieslēgto gēnu identificēšanu un šo gēnu saraksta ģenerēšanu. DNS mikroarray analīze ir metode, ko zinātnieki izmanto, lai noteiktu, vai gēni ir ieslēgti vai izslēgti.

1. Kam izmanto mikromasīvu analīzi?
2. Kāpēc zinātnieki izmanto mikromasīvu?
3. Kā mūsdienās tiek izmantota mikroarray analīze?
4. Ko var noteikt mikroarray analīze?
5. Kas ir mikromasīvs bioinformātikā?
6. Kāds ir eksonu slazdošanas mērķis?
7. Kādi ir mikromasīvu pielietojumi?
8. Kāda ir DNS mikromasīvu nozīme?
9. Kā zinātnieki nosaka organisma ģenētisko secību?
10. Kā darbojas mikromasīvs un kā tas tiek izmantots?
11. Kura no šīm tehnoloģijām tiek izmantota mikromasīvu ražošanā?
12. Kādi rīki tiek izmantoti mikromasīvu analīzei?
13. Kas ir mikroarray tehnika?
14. Cik precīza ir mikroarray testēšana?
15. Ko CMA var noteikt?

Kam izmanto mikromasīvu analīzi?

Mikromasīvs ir laboratorijas rīks, ko izmanto, lai vienlaikus noteiktu tūkstošiem gēnu ekspresiju. DNS mikromasīvi ir mikroskopa priekšmetstikliņi, kas ir izdrukāti ar tūkstošiem sīku plankumu noteiktās pozīcijās, un katrs plankums satur zināmu DNS sekvenci vai gēnu.

Kāpēc zinātnieki izmanto mikromasīvu?

Faktiski mikroarray analīze ļauj pētniekiem aplūkot ekspresijas modeļus visos gēnos visā genomā — un to izdarīt vienā procedūrā. Līdz ar to tagad ir iespējams vienlaicīgi uzraudzīt desmitiem tūkstošu gēnu darbību.

Kā mūsdienās tiek izmantota mikroarray analīze?

Mūsdienās DNS mikroshēmas izmanto dažu slimību klīniskās diagnostikas testos. ... Mikromasīvus var izmantot arī, lai izpētītu, cik lielā mērā noteikti gēni ir ieslēgti vai izslēgti šūnās un audos. Šajā gadījumā DNS izolēšanas vietā no paraugiem tiek izolēta un izmērīta RNS (kas ir DNS transkripts).

Ko var noteikt mikroarray analīze?

Ko nosaka hromosomu mikroarray? Hromosomu mikroarray (CMA) testēšana meklē papildu (dublētus) vai trūkstošus (dzēstus) hromosomu segmentus, ko dažreiz sauc par kopiju skaita variantiem (CNV).

Kas ir mikromasīvs bioinformātikā?

"Mikromasīvs" ir laboratorijas priekšmetstiklis, kas izgatavots no stikla, kura virsma ir nodrošināta ar tūkstošiem mazu poru noteiktās pozīcijās. Tas darbojas saskaņā ar DNS komplementāru virkņu hibridizācijas principu un ļauj efektīvi analizēt vairāku gēnu izpausmes vienā reakcijā.

Kāds ir eksonu slazdošanas mērķis?

Eksonu slazdošana ir molekulārās bioloģijas paņēmiens, lai identificētu potenciālos eksonus nezināmas intron-eksona struktūras eikariotu DNS fragmentā. Tas tiek darīts, lai noteiktu, vai fragments ir daļa no izteikta gēna.

Kādi ir mikromasīvu pielietojumi?

Pašreizējā mikroarray lietojumu joma ietver sekvencēšanu ar hibridizāciju, atkārtotu sekvencēšanu, mutāciju noteikšanu, gēnu kopiju skaita novērtēšanu, salīdzinošo genoma hibridizāciju, zāļu atklāšanu, ekspresijas analīzi un imūntestu (olbaltumvielu mikromasīvus).

Kāda ir DNS mikromasīvu nozīme?

DNS mikromasīvs ir efektīvs instruments transkriptomikā, kas palīdz mums pētīt un analizēt gandrīz katra organismā esošā gēna mRNS ekspresiju. Līdz ar mikroorganismu visa genoma sekvencēšanas pieejamību tagad ir kļuvis iespējams identificēt gēnus ar potenciālu bioremediācijai.

Kā zinātnieki nosaka organisma ģenētisko secību?

Šie burti un krāsas apzīmē DNS kodu — ķīmiskās vielas, kas veido mūsu ģenētiskā projekta daļu. Zinātnieki var ņemt paraugus, izmantojot uztriepes no organismiem, un “nolasīt” to DNS, izmantojot procesu, ko sauc par DNS sekvencēšanu.

Kā darbojas mikromasīvs un kā tas tiek izmantots?

Mikromasīvu princips ir tāds, ka komplementāras sekvences saistās viena ar otru. Nezināmās DNS molekulas sagriež fragmentos ar restrikcijas endonukleāzēm; šiem DNS fragmentiem ir pievienoti fluorescējošie marķieri. Pēc tam tiem ļauj reaģēt ar DNS mikroshēmas zondēm.

Kura no šīm tehnoloģijām tiek izmantota mikromasīvu ražošanā?

Mikromasīvus var izgatavot, izmantojot dažādas tehnoloģijas, tostarp drukāšanu ar smalkām tapām uz stikla priekšmetstikliņiem, fotolitogrāfiju, izmantojot iepriekš izgatavotas maskas, fotolitogrāfiju, izmantojot dinamiskas mikrospoguļa ierīces, tintes drukāšanu vai elektroķīmiju uz mikroelektrodu blokiem.

Kādi rīki tiek izmantoti mikromasīvu analīzei?

Tikai trīs rīki var apstrādāt visu veidu klasiskos mikromasīvus, proti, ArrayExpress un NCBI GEO uzglabāšanai un Bioconductor analīzei.

Kas ir mikroarray tehnika?

Microarray tehnoloģija ir jaunattīstības tehnoloģija, ko izmanto, lai vienlaikus pētītu daudzu gēnu ekspresiju. Tas ietver tūkstošiem gēnu sekvenču ievietošanu zināmās vietās uz stikla priekšmetstikliņa, ko sauc par gēnu mikroshēmu. Paraugs, kas satur DNS vai RNS, tiek novietots saskarē ar gēna mikroshēmu.

Cik precīza ir mikroarray testēšana?

CMA ir 100% precīza, nosakot parastās aneuploīdijas pirmsdzemdību paraugos, salīdzinot ar kariotipu (2, 16, 17), un NICHD pētījumā tas uzrādīja lielāku diagnostisko iznākumu salīdzinājumā ar standarta kariotipēšanu par 1.7% pacientu, kas nosūtīti uz progresējošu mātes, vecāku nemieru un pozitīvu seruma skrīningu (2).

Ko CMA var noteikt?

Pirmsdzemdību CMA salīdzina konkrētus nedzimušā bērna DNS reģionus ar normāla genoma reģioniem. CMA var noteikt hromosomu dublēšanos vai dzēšanu — vietas, kur ir papildu vai trūkstoši DNS gabali, kas nav atklāti ar standarta kariotipa testu.